SimpleFold: Folding proteins is simpler than you think
Apple выпустила open-source библиотеку ML-SimpleFold для предсказания трёхмерной структуры белков на основе их аминокислотной последовательности. Она использует архитектуру трансформеров и оптимизирована для эффективного обучения и инференса на GPU. Код написан на PyTorch и включает инструменты для подготовки данных, обучения моделей и визуализации результатов.
Библиотека поддерживает предсказание структур как отдельных белков, так и комплексов, с акцентом на скорость и воспроизводимость. Это демонстрирует растущий интерес крупных tech-компаний к computational biology. Практический вывод: инструмент упрощает исследования в биоинформатике, снижая барьер входа для научных групп без мощных вычислительных ресурсов.